Pflanz ist ein erfahrener Profi im Fußball. Er war ehemals DFB-Stützpunkttrainer in Hünfeld und schaffte nach Stationen bei der SG Aulatal und dem TSV Künzell den Sprung in den Profifußball: Als Co-Trainer beim belgischen Erstligisten KV Oostende stand er Alexander Blessin zur Seite (derzeit beim FC St. Pauli). Während seiner Zeit bei Oostende übernahm er sogar für die letzten fünf Pflichtspiele den Cheftrainerposten.
Seine Karriere führte ihn weiter zu VV St. Truiden in Belgien, wo er unter Bernd Hollerbach (unter anderem Hamburger SV und Hansa Rostock) als Co-Trainer tätig war. Für kurze Zeit war Pflanz auch als Cheftrainer in Aalen im Einsatz und spielte mit dem VFR unter anderem gegen die SG Barockstadt Fulda-Lehnerz.
Besonders bemerkenswert ist, dass Markus es vom kleinen Dorfverein bis in den Profifußball geschafft hat und seine Profitrainerlizenz in Belgien erwarb.