Geboren am 19. Juni 1947 in Guggenberg (Kreis Miltenberg), besuchte Josef Gebauer das Gymnasium des Albertus-Magnus-Kollegs in Königstein/Taunus und legte dort 1966 sein Abitur ab. In den Jahren 1966 bis 1968 studierte er Philosophie und Theologie in Königstein/Taunus. Danach besuchte Josef Gebauer 1969 bis 1973 die Fachhochschule für Sozialwesen in Mannheim. Seine Diakonatsausbildung fand in den Jahren 1994 bis 1997 im Institut für Pastorale Bildung der Erzdiözese Freiburg und anschließend über der Würzburger Fernkurs statt. Am 10. Juni 2000 wurde er von Weihbischof Johannes Kapp im Fuldaer Dom zum Diakon geweiht.
Von Juli 2000 bis Juni 2017 war er als Diakon im Zivilberuf in der Pfarrei St. Lukas Fulda tätig. Auf eigenen Wunsch war er nach Vollendung seines 70. Lebensjahres weiterhin im diakonischen Dienst und wirkte ab Juli 2017 im Pastoralverbund St. Rochus Fulda. In den Jahren 2007 bis 2011 war er Sprecher der Diakone im Diakonenkreis Fulda. Darüber hinaus war Josef Gebauer langjährig als Referent für soziale Dienste im Caritasverband tätig und wirkte auch dort in seiner ruhigen und wohltuenden Art segensreich für viele Menschen.
Das Requiem wird am Mittwoch, 5. Februar 2025, um 9.45 Uhr in der Kirche St. Lukas Fulda-Aschenberg gefeiert. Um 11.30 Uhr findet die Trauerfeier/Beisetzung am Frauenbergfriedhof statt.